科目名称：［MM441-101J］選択生物Ⅱ（2023年度）
| 科目責任者 | 中村 真樹 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 科目対象学年 | 1～3 | 科目授業期間 | 秋学期 | 科目時限数 | 15 | 科目分類 | 講義 |
科目について
インターネットとゲノム科学の発展に伴い，ネットワークを通じて様々な医学・生物学情報および解析ツールを利活用できるようになった。本講では，利用の前提となる分子生物学的な基礎知識を補いながら，国際データベース，DNA・タンパク質配列検索，遺伝情報発現，分子系統解析，タンパク質立体構造，遺伝子発現プロファイル，パスウェイ解析，遺伝的多様性について，データ検索や解析方法などの具体的な内容を学修する。本講の学修クラスおよび学修ガイドに，講義毎の内容に関連するデータベースと電子書籍へのリンクを掲載しているので，20分間程度の事前自己学修を行うことでより深く講義内容を理解することができる。
以下に関連する医学教育モデル・コア・カリキュラム項目内容を記す。
【平成28年度】C-1-1)-(2) ゲノム・染色体・遺伝子 | C-1-2)-(1) 生物の進化 | C-4-1) 遺伝的多様性と疾患 | E-1-1) 遺伝医療・ゲノム医療と情報の特性
【令和4年度】PS-01-01：生命現象の科学（メンデルの法則、ミトコンドリア遺伝、エピゲノム修飾(インプリンティングを含む)及び多因子遺伝；遺伝型と表現型；ゲノムと染色体及び遺伝子の構造と関係性、体細胞分裂及び減数分裂における染色体の挙動；DNAからRNAへの転写、タンパク質合成に至る翻訳を含む遺伝情報の発現及び調節(セントラルドグマ)；染色体分析・DNA配列決定を含むゲノム解析技術；進化の基本的な考え方；生物種とその系統関係；アミノ酸配列や塩基配列の比較による分子系統樹）｜PS-01-02：個体の構成と機能（酵素の機能と調節；タンパク質の構造）｜PS-01-04：病因と病態（ゲノムの多様性；単一遺伝子疾患、染色体異常による疾患、ミトコンドリア遺伝子の変異による疾患；多因子疾患における遺伝要因と環境要因の関係；薬剤の有効性や安全性とゲノムの多様性との関係；がんの原因や遺伝子変化）｜PS-03-01：遺伝医療・ゲノム医療（ハーディ・ワインベルグの法則；家系図；生殖細胞系列変異と体細胞変異の違い、遺伝学的検査；遺伝医学関連情報アクセス）
受講前に必要とされる知識及び技能・態度
遺伝子発現やタンパク質の機能・構造など，細胞生物学および分子生物学の基礎的な知識と，パソコン操作およびインターネット利用の技能を必要とする。科目の評価について
小テスト（50％）および筆記試験（50％）とし，ユニットの評価を行う。総合評価が60％（グレードC）以上を合格とする。再試験は実施しない。小テストは毎回の講義の最後にMCQ形式で行い，講義終了後に個別に採点結果と解答・解説を通知する。また，筆記試験終了後に解答・解説を提示する。指定教科書他
［教科書］特に指定しない。［参考書］
A. 「よくわかるバイオインフォマティクス入門」，藤博幸 編，講談社，2018 ISBN-13:978-4065138212
B. 「バイオインフォマティクス入門 第２版」，日本バイオインフォマティクス学会 編，慶應義塾大学出版会，2021 ISBN-13:978-4766427912
C. 「ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー」，岡田随象，羊土社，2020 ISBN-13:978-4758120920
D. 「エッセンシャル構造生物学」，河合剛太・坂本泰一・根本直樹 共著，講談社，2018 ISBN-13:978-4065038000
E. 「基礎分子遺伝学・ゲノム科学」，坂本順司 著，裳華房，2018 ISBN-13:978-4785352370
F. 「診療・研究にダイレクトにつながる遺伝医学」，渡邉淳 著，羊土社，2017 ISBN-13:978-4758120623
G. 「はじめてのバイオインフォマティクス」，藤博幸 編集，講談社，2006 ISBN-13:978-4061538627
H. 「よくわかるゲノム医学 改訂第２版」，菅野純夫 監修，羊土社，2016 ISBN-13:978-4758120661
I. 「これからのゲノム医療を知る」，中村祐輔 著，羊土社，2009 ISBN-13:978-4758120043
J. 「Webで実践 生物学情報リテラシー」，広川貴次・美宅成樹 著，中山書店，2013 ISBN-13:978-4521737720
授業日程一覧（ユニット名称：選択生物Ⅱ） （2023年度）
| コマ数 | 形態 | 授業タイトル |
|---|---|---|
| 1 | 講義 | 医学・生物学系の主要なデータベース |
| 2 | 講義 | 生命情報の流れ－ゲノム，トランスクリプトーム，プロテオーム |
| 3 | 講義 | ゲノム・核酸配列（１）－相同性検索 |
| 4 | 講義 | ゲノム・核酸配列（２）－遺伝子領域と機能予測 |
| 5 | 講義 | ゲノム・核酸配列（３）－転写因子検索 |
| 6 | 講義 | ゲノム・核酸配列（４）－ゲノムブラウザー |
| 7 | 講義 | タンパク質配列（１）－マルチプルアライメントと分子系統 |
| 8 | 講義 | タンパク質配列（２）－ファミリー・ドメイン・モチーフ |
| 9 | 講義 | タンパク質立体構造－構造データと構造分類 |
| 10 | 講義 | 発現プロファイル－遺伝子発現データ |
| 11 | 講義 | パスウェイ解析－代謝マップとシステムバイオロジー |
| 12 | 講義 | ゲノム多様性－一塩基多型とハプロタイプ |
| 13 | 講義 | 遺伝子疾患情報－OMIM |
| 14 | 講義 | 医学文献情報の検索と管理 |
| 15 | 講義 | バイオインフォマティクス－最近の話題 |